Mikrobiologisk undersökning göras vid misstanke om infektion. Prov tas vanligtvis från sår, hud, slemhinnor och urin, men tas även från andra kroppsvätskor, t.e.x. ryggmärgsvätska. Det är viktigt att provtagningen görs aseptiskt, bakteriefritt, så att provet inte förorenas. Bakterier odlas sedan fram på en apeciell odlingsplatta.